Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms