Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPCQ01831 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPCQ01831 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
XPCQ01831 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPCQ01831 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPCQ01831 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XPCQ01831 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XPCQ01831 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XPCQ01831 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XPCQ01831 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XPCQ01831 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XPCQ01831 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
XPCQ01831 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
XPCQ01831 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
XPCQ01831 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
XPCQ01831 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
XPCQ01831 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
XPCQ01831 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XPCQ01831 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XPCQ01831 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XPCQ01831 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
XPCQ01831 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
XPCQ01831 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPCQ01831 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPCQ01831 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPCQ01831 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPCQ01831 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPCQ01831 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPCQ01831 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPCQ01831 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPCQ01831 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
XPCQ01831 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPCQ01831 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPCQ01831 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPCQ01831 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
XPCQ01831 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPCQ01831 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPCQ01831 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
XPCQ01831 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPCQ01831 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
XPCQ01831 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPCQ01831 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPCQ01831 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPCQ01831 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPCQ01831 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPCQ01831 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPCQ01831 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPCQ01831 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPCQ01831 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPCQ01831 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPCQ01831 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
XPCQ01831 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPCQ01831 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPCQ01831 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPCQ01831 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPCQ01831 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
XPCQ01831 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPCQ01831 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms