Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms