Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms