Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms