Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD3P84022 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms