Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms