Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BACE1P56817 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BACE1P56817 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BACE1P56817 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BACE1P56817 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BACE1P56817 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BACE1P56817 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BACE1P56817 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BACE1P56817 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BACE1P56817 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BACE1P56817 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BACE1P56817 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BACE1P56817 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BACE1P56817 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BACE1P56817 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BACE1P56817 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BACE1P56817 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BACE1P56817 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BACE1P56817 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BACE1P56817 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BACE1P56817 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BACE1P56817 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BACE1P56817 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BACE1P56817 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms