Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN8P56748 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms