Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms