Protein–RNA interactions for Protein: P52907

CAPZA1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA1P52907 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms