Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR4P51679 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCR4P51679 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCR4P51679 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCR4P51679 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCR4P51679 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCR4P51679 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCR4P51679 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCR4P51679 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCR4P51679 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCR4P51679 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCR4P51679 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms