Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms