Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPOP42166 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPOP42166 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPOP42166 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPOP42166 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPOP42166 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPOP42166 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPOP42166 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPOP42166 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPOP42166 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPOP42166 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPOP42166 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPOP42166 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPOP42166 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPOP42166 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPOP42166 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPOP42166 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPOP42166 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPOP42166 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPOP42166 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPOP42166 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPOP42166 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPOP42166 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPOP42166 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPOP42166 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPOP42166 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPOP42166 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPOP42166 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPOP42166 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPOP42166 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPOP42166 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPOP42166 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPOP42166 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPOP42166 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPOP42166 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPOP42166 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPOP42166 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPOP42166 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPOP42166 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPOP42166 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPOP42166 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPOP42166 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPOP42166 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPOP42166 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPOP42166 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPOP42166 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPOP42166 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPOP42166 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPOP42166 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPOP42166 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPOP42166 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPOP42166 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPOP42166 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPOP42166 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPOP42166 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPOP42166 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPOP42166 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPOP42166 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPOP42166 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPOP42166 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPOP42166 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPOP42166 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPOP42166 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPOP42166 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPOP42166 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPOP42166 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPOP42166 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPOP42166 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMPOP42166 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMPOP42166 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMPOP42166 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMPOP42166 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TMPOP42166 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMPOP42166 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMPOP42166 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMPOP42166 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMPOP42166 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPOP42166 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPOP42166 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPOP42166 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPOP42166 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPOP42166 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPOP42166 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPOP42166 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPOP42166 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPOP42166 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPOP42166 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPOP42166 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPOP42166 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPOP42166 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPOP42166 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPOP42166 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms