Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF9P41273 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms