Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms