Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms