Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC27P30260 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC27P30260 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC27P30260 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC27P30260 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC27P30260 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC27P30260 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC27P30260 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC27P30260 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC27P30260 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC27P30260 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC27P30260 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC27P30260 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC27P30260 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC27P30260 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC27P30260 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC27P30260 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC27P30260 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC27P30260 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC27P30260 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC27P30260 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC27P30260 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC27P30260 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC27P30260 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC27P30260 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC27P30260 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC27P30260 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC27P30260 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC27P30260 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC27P30260 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC27P30260 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC27P30260 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC27P30260 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC27P30260 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC27P30260 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC27P30260 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC27P30260 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC27P30260 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC27P30260 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC27P30260 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC27P30260 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC27P30260 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC27P30260 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC27P30260 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC27P30260 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC27P30260 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC27P30260 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC27P30260 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC27P30260 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC27P30260 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC27P30260 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC27P30260 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC27P30260 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC27P30260 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC27P30260 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC27P30260 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC27P30260 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC27P30260 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC27P30260 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC27P30260 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC27P30260 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC27P30260 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC27P30260 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms