Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB2P29033 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB2P29033 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB2P29033 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB2P29033 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB2P29033 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB2P29033 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB2P29033 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB2P29033 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB2P29033 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB2P29033 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB2P29033 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB2P29033 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB2P29033 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB2P29033 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB2P29033 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB2P29033 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB2P29033 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB2P29033 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB2P29033 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB2P29033 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB2P29033 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB2P29033 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB2P29033 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GJB2P29033 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GJB2P29033 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GJB2P29033 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB2P29033 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB2P29033 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB2P29033 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB2P29033 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB2P29033 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB2P29033 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB2P29033 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB2P29033 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB2P29033 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB2P29033 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB2P29033 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB2P29033 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB2P29033 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB2P29033 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB2P29033 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB2P29033 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB2P29033 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB2P29033 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB2P29033 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB2P29033 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB2P29033 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB2P29033 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB2P29033 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB2P29033 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB2P29033 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB2P29033 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB2P29033 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB2P29033 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms