Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms