Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms