Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms