Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms