Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPI1P17947 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPI1P17947 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPI1P17947 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPI1P17947 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPI1P17947 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPI1P17947 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPI1P17947 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPI1P17947 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPI1P17947 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPI1P17947 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPI1P17947 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPI1P17947 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPI1P17947 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPI1P17947 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPI1P17947 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPI1P17947 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPI1P17947 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPI1P17947 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPI1P17947 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms