Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSPP15924 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DSPP15924 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSPP15924 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSPP15924 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSPP15924 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSPP15924 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSPP15924 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSPP15924 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DSPP15924 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSPP15924 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DSPP15924 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSPP15924 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSPP15924 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSPP15924 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSPP15924 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms