Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms