Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms