Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms