Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ86

DUX4L3, Double homeobox protein 4-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L3P0CJ86 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4L3P0CJ86 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms