Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCP08575 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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