Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOP08100 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOP08100 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOP08100 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOP08100 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOP08100 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOP08100 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOP08100 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOP08100 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOP08100 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOP08100 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOP08100 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOP08100 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOP08100 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOP08100 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOP08100 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOP08100 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOP08100 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOP08100 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOP08100 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOP08100 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOP08100 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOP08100 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOP08100 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOP08100 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOP08100 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOP08100 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOP08100 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOP08100 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOP08100 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOP08100 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOP08100 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOP08100 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms