Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFMP07197 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFMP07197 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFMP07197 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFMP07197 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFMP07197 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFMP07197 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFMP07197 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFMP07197 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFMP07197 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFMP07197 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFMP07197 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFMP07197 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFMP07197 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFMP07197 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFMP07197 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFMP07197 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFMP07197 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFMP07197 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFMP07197 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFMP07197 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFMP07197 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFMP07197 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFMP07197 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFMP07197 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFMP07197 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFMP07197 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFMP07197 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFMP07197 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFMP07197 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFMP07197 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFMP07197 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFMP07197 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFMP07197 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFMP07197 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFMP07197 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFMP07197 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFMP07197 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFMP07197 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFMP07197 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFMP07197 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFMP07197 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFMP07197 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms