Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX3O95343 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX3O95343 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX3O95343 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX3O95343 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX3O95343 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX3O95343 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX3O95343 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX3O95343 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX3O95343 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX3O95343 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX3O95343 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX3O95343 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX3O95343 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX3O95343 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX3O95343 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX3O95343 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX3O95343 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX3O95343 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX3O95343 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX3O95343 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX3O95343 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX3O95343 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX3O95343 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX3O95343 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX3O95343 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX3O95343 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX3O95343 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX3O95343 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX3O95343 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX3O95343 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX3O95343 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX3O95343 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX3O95343 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX3O95343 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX3O95343 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX3O95343 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX3O95343 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX3O95343 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX3O95343 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX3O95343 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX3O95343 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX3O95343 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX3O95343 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX3O95343 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX3O95343 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX3O95343 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX3O95343 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX3O95343 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX3O95343 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX3O95343 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX3O95343 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX3O95343 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX3O95343 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX3O95343 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX3O95343 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX3O95343 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX3O95343 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX3O95343 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX3O95343 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX3O95343 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX3O95343 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX3O95343 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX3O95343 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX3O95343 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX3O95343 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX3O95343 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX3O95343 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX3O95343 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms