Protein–RNA interactions for Protein: O60462

NRP2, Neuropilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRP2O60462 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NRP2O60462 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRP2O60462 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRP2O60462 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRP2O60462 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRP2O60462 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRP2O60462 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRP2O60462 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRP2O60462 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRP2O60462 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRP2O60462 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRP2O60462 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRP2O60462 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRP2O60462 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRP2O60462 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRP2O60462 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRP2O60462 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NRP2O60462 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRP2O60462 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRP2O60462 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRP2O60462 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRP2O60462 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRP2O60462 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRP2O60462 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRP2O60462 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRP2O60462 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRP2O60462 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRP2O60462 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NRP2O60462 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRP2O60462 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRP2O60462 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRP2O60462 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms