Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms