Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HACD1B0YJ81 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HACD1B0YJ81 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HACD1B0YJ81 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HACD1B0YJ81 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HACD1B0YJ81 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD1B0YJ81 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD1B0YJ81 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD1B0YJ81 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD1B0YJ81 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD1B0YJ81 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD1B0YJ81 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD1B0YJ81 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD1B0YJ81 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD1B0YJ81 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD1B0YJ81 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD1B0YJ81 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD1B0YJ81 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD1B0YJ81 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD1B0YJ81 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD1B0YJ81 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD1B0YJ81 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD1B0YJ81 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD1B0YJ81 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD1B0YJ81 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD1B0YJ81 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms