Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms