Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms