Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms