Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POMPQ9Y244 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POMPQ9Y244 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms