Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SRP68Q9UHB9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRP68Q9UHB9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms