Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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