Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms