Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms