Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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RDH8Q9NYR8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RDH8Q9NYR8 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RDH8Q9NYR8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RDH8Q9NYR8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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