Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms