Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms