Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms