Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DUOX2Q9NRD8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms