Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RAB9BQ9NP90 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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RAB9BQ9NP90 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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